Căn cứ Nghị định số 145/2020/NĐ-CP ngày 14 tháng 12 năm 2020 của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Bộ luật Lao động về điều kiện lao động và quan hệ lao động (gọi tắt là Nghị định số 145/2020/NĐ-CP)
Về nguyên tắc việc chiết khấu thương mại căn cứ vào số lượng, doanh số hàng hóa, dịch vụ thì số tiền chiết khấu của hàng hóa đã bán được tính điều chỉnh trên hóa đơn bán hàng hóa, dịch vụ của lần mua cuối cùng hoặc kỳ tiếp sau. Trường hợp số tiền chiết khấu được lập khi kết thúc chương trình (kỳ) chiết khấu hàng bán thì được lập hóa đơn điều chỉnh kèm bảng kê các số hóa đơn cần điều chỉnh, số tiền, tiền thuế điều chỉnh. Căn cứ vào hóa đơn điều chỉnh, bên bán và bên mua kê khai điều chỉnh doanh thu, tiền thuế tương ứng.
Trường hợp người nộp thuế đã ủy quyền cho Công ty thực hiện quyết toán thuế thay. Nếu phát hiện người nộp thuế thuộc diện phải trực tiếp quyết toán thuế với cơ quan thuế:
Trường hợp trong quá trình giải quyết hồ sơ hoàn thuế, Tổng Cục thuế hướng dẫn Cục Thuế địa phương, trường hợp Cục Thuế xác định số thuế đủ điều kiện được hoàn thì giải quyết hoàn trả số thuế đã đủ điều kiện hoàn cho người nộp thuế, không chờ kết quả kiểm tra xác minh toàn bộ hồ sơ hoàn thuế; đối với số thuế cần kiểm tra xác minh hoặc yêu cầu người nộp thuế giải trình, bổ sung hồ sơ thì xử lý hoàn thuế khi có đủ điều kiện theo quy định.
Trường hợp công trình xây dựng chưa được cơ quan Nhà nước có thẩm quyền cấp giấy phép xây dựng đồng thời cũng không thuộc đối tượng được miễn giấy phép xây dựng theo quy định tại Điều 89 Luật xây dựng năm 2014, chưa được cơ quan Nhà nước có thẩm quyền cấp chứng nhận quyền sở hữu tài sản gắn liền với đất thì tài sản cố định hình thành trên đất thuê của Công ty không đủ điều kiện được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào và không đủ điều kiện được trích khấu hao tài sản tính vào chi phí khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp.
Trường hợp người nộp thuế (NNT) chưa tính giảm trừ gia cảnh cho người phụ thuộc là con ruột trong năm tính thuế 2023 thì được tính giảm trừ cho người phụ thuộc kể từ tháng phát sinh nghĩa vụ nuôi dưỡng khi NNT thực hiện quyết toán thuế và có đăng ký giảm trừ.
Trường hợp việc chiết khấu thương mại căn cứ vào số lượng, doanh số hàng hóa, dịch vụ thì số tiền chiết khấu của hàng hóa đã bán được tính điều chỉnh trên hóa đơn bán hàng hóa, dịch vụ của lần mua cuối cùng hoặc kỳ tiếp sau. Trường hợp số tiền chiết khấu được lập khi kết thúc chương trình (kỳ) chiết khấu hàng bán thì được lập hóa đơn điều chỉnh kèm bảng kê các số hóa đơn cần điều chỉnh, số tiền, tiền thuế điều chỉnh. Trên hóa đơn điều chỉnh Công ty không ghi số âm do không phải trường hợp hóa đơn sai sót.
Trường hợp Công ty phát sinh số thuế phải nộp theo Quyết định ấn định thuế của cơ quan Hải quan, trừ trường hợp cơ quan Hải quan xử phạt về gian lận, trốn thuế thì:
Trường hợp Công ty có trụ sở chính tại tỉnh Bình Dương, thực hiện dự án đầu tư mới tại tỉnh Bình Định. Tháng 2/2021, dự án đã đi vào hoạt động. Công ty không nộp hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mà thực hiện kết chuyển số thuế GTGT của dự án đầu tư chưa được hoàn sang tờ khai mẫu 01/GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh thì nếu số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa xuất khẩu (bao gồm số thuế GTGT đầu vào của hoạt động đầu tư, xây dựng, hình thành tài sản cố định đáp ứng quy định pháp luật về đầu tư và phục vụ hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa xuất khẩu), sau khi bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hàng hóa, dịch vụ tiêu thụ nội địa còn lại từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế. Số thuế GTGT được hoàn của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu không vượt quá doanh thu của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu nhân (x) với 10%.
Theo quy định hiện hành, Doanh nghiệp có hoạt động sản xuất phần mềm phải nộp “BÁO CÁO TÌNH HÌNH HOẠT ĐỘNG SẢN XUẤT PHẦN MỀM” hàng năm cho Bộ Thông Tin và Truyền Thông, chậm nhất là ngày 15/03 của năm sau. Mặc dù không có hướng dẫn rõ ràng về mặt văn bản, thực tế các cuộc thanh – kiểm tra thuế gần đây có xu hướng xem xét báo cáo này như một căn cứ quan trọng để đánh giá, xác định doanh nghiệp có đáp ứng quy trình sản xuất phần mềm hay không cho mục đích áp dụng ưu đãi thuế TNDN.
Trường hợp Công ty đã được Cục thuế thực hiện kiểm tra tại trụ sở và đã ban hành Quyết định xử phạt về thuế, sau đó Công ty phát hiện hồ sơ khai quyết toán thuế TNDN của các kỳ bị thanh tra có sai sót nếu việc khai bổ sung sẽ làm giảm số tiền thuế phải nộp thì thực hiện theo quy định tại khoản 3 Điều 47 Luật Quản lý thuế số38/2019/QH14.
Theo trình bày của Công ty thì phần mềm trong trường hợp của Công ty là phần mềm ứng dụng, nên trị giá hải quan của mặt hàng đĩa CD có chứa phần mềm quản lý được xác định là giá thực tế đã thanh toán hay sẽ phải thanh toán của phương tiện trung gian, không bao gồm trị giá của phần mềm ứng dụng nêu trên hóa đơn thương mại, trị giá của phần mềm ứng dụng được tách riêng với trị giá của phương tiện trung gian.
